Торговали ли между собой Япония и СССР в 1941−1945 годах и чем?

Нет. Никакой торговли между странами находящимися в состоянии войны, или уже воюющими, не было.

Поэтому, если применить к данному вопросу современные Россию и Украину то все заверения власти Украины об агрессии России не более чем обман. Торговля между странами есть, причем в немалых объемах, Россия продает Украине электроэнергию, уголь, нефть, нефтепродукты, и т.д., а газ им теперь идет по реверсу из Европы, но это тоже российский газ.

До 8 августа 1945 года никакой войны между СССР и Японией не было.

До 1944 года на Северном (нашем) Сахалине существовала японская нефтяная концессия, угольные были, но их, вроде, пораньше прикрыли. За её ликвидацию СССР выплатил Японии компенсацию и обязался поставлять ей нефть- за 1944- 1945 год (до начала военных действий) СССР поставил Японии около 800 тонн нефти.

http://rusplt.ru/fact/do-1944-goda-yaponiya-dobyivala-v-sssr-neft-7280.html

Насколько я знаю историю, после окончания ВОВ мы помогали Америке перебить японцев. Исходя из этого не думаю что были какие-то торговые отношения.